En la segunda parte Fabián Estay anotaría al minuto 68, finalmente el minuto 81′ llegaba acompañado de un córner ejecutado directo a la cabeza de Calderón poniendo el marcador 3-0 (4-4 global que mandaba a penales el cotejo), pero un gol de último minuto de Wálter Samuel calificó a los Xeneizes a la final. En ese mismo año, en el torneo de Verano 2001 con el técnico Alfio Basile, logran el liderato general, gracias a la incorporación de jugadores como Ricardo Rojas, Iván Zamorano, Frankie Oviedo, José Luis Calderón y Fabián Estay, camiseta manchester city pero finalmente caen en semifinales con el Pachuca.
